Melnā Rhino genoma sekvencēšana var izglābt izzušanas sugas

21. gadsimtā ir fantastisks laiks būt bioinženierim un briesmīgam laikam, lai kļūtu par melnu degunradzi. Āfrikas sugas, kas pirms gadsimta bija 850 000, ir strauji samazinājušās par aptuveni 5000 cilvēku. Vienu dienu cerot uz šo katastrofālo kritumu, biologi cenšas izspiest sekojošo secību. diceros bicornis bicornis genomu.

Projekts ir kopīgs darbs starp vairākiem biotehnoloģiju ekspertiem, kas ir ieinteresēti dabas aizsardzības jomā, tostarp Vašingtonas Universitātes patologs un bioinženieris Dr. Charles Murray un Matthew Markus, Pembient vadītājs. Pembient ir Sanfrancisko biotehnoloģijas uzņēmums, kas vēlas pārpludināt Ķīnas tirgus ar sintētiskiem - bet bioloģiski identiskiem - rino ragiem, 3D drukātiem no laboratorijas izgatavotiem keratīniem un, iespējams, piegādāti kā rhino alus. (Keratīns ir jūsu nagiem un rhino ragiem izgatavotais materiāls. Tas nav ne maģisks, ne medicīnisks.) Pembient varēja pietiekami daudz mācīties no viena nino vārda Ntombi genoma. Apgrieztā, lai uzlabotu to, kā tā sintezē rhino proteīnus.

Bet pirms ikviens var iegūt datus par Ntombi ģenētiku, vispirms ir jānorāda melnais rhino genoms. Projekts ir apmēram pusceļā, lai palielinātu $ 16,500 par Experiment.com, kas ir kopīga finansēšanas platforma, piemēram, Kickstarter, izņemot zinātni, nevis atjaunojot sen mirušās videospēles.

"Joprojām ir salīdzinoši maz organismu, kuru genomi ir sekvencēti," saka Murray. „Vēl nesen tas bija ļoti grūti - laikietilpīgs un dārgs.”

Tas nenozīmē, ka dzīvnieki nesaņem savus genomus. Projekta Genome 10K mērķis ir savākt ģenētisko datu Noasa šķirni. Un dienvidu balto degunradzi, kas ir daudz populārāka un lielāka suga, genoma sekvencēja 2012. gadā. Bet kā ar melnajiem rinīniem, piemēram, Ntombi? „Nav skaidrs, kāpēc melnās degunradzis tik ilgi palicis sānos,” saka Markuss. Viņš runā par izlaidumu, lai notiktu; bet tas varētu būt, ka, tā kā dienvidu baltumi jau bija sakārtoti, melnais rhino nebija prioritāte.

Markus, Murray, un viņu līdzstrādnieki cenšas šo plaisu aizvērt. Ntombi, posteņa rhino projektam, jau ir sagatavojis un saglabājis asinis - un bingo! Rhino DNS. Secinājumam jābūt diezgan vienkāršam, sacīja Murray. "Tas ir liels palīdzēt, lai baltais rhino genoms būtu salīdzinošais kritērijs."

Nākamie soļi secībā

Ar Ntombi DNS, kas atrodas DNSnexsus serveros, biologi būs izveidojuši pamatu salīdzinošajai rhino genomikai. "Kad mēs iegūsim savu secību, mēs varam sākt saprast, kas padara rino degunradzi, kā balts atšķiras no melnās krāsas," saka Murray, "un sniedz informāciju, kas palīdzēs izsekot salātos paraugus."

Veterinārārsti varēja pārbaudīt iespējami slimību izraisošus gēnus, un tiem ir pamats, lai salīdzinātu pārējās septiņas melnās rhino pasugas - trīs no tām jau ir izmirušas.

Dzīvnieki pēc rītdienas

Pēc tam, kad būsim stingrāka izpratne par melno degunradžu ģenētiku, vairākas teorētiskās durvis ir atvērtas. “No ceļa es esmu sajūsmā par cilmes šūnu izmantošanu, lai saprastu degunradzi un, iespējams, audzētu rhino ragus laboratorijā, lai samazinātu malumedniecību,” saka Murray.

Markus prognozē nedaudz tālāk. Par diceros bicornis bicornis Markus nav iedomājies tik daudz mamuta stila izzušanas, bet atcelt ģenētisko pulksteni; mazākas populācijas, jo vairāk pakļautas tām mantotām problēmām.

Un melnajiem rhinos, kas ir aizgājuši? Viņš salīdzina šos centienus ar Ziemeļu baltā rhino genoma, kas ir San Diego zooloģiskajā dārzā, sekvences secību. Ir runāts par mēģinājumu iegūt dienvidu balto degunradzi (no kuras ir 20 000), lai veiktu ziemeļu balto degunradzi (no kuras ir 5). Markuss runā ar piesardzīgu, rūpīgu optimismu: „Potenciāli - varbūt - varbūt izmirušās melnās rhino pasugas varētu atkal atdzīvināt.”